Файл с расширением файла PDB, скорее всего, является файлом, созданным в формате базы данных программы, который используется для хранения отладочной информации о программе или модуле, например DLL или EXE-файле. Их иногда называют символьными файлами.
Файлы PDB сопоставляют различные компоненты и операторы в исходном коде с его окончательным скомпилированным продуктом, который затем отладчик может использовать для поиска исходного файла и местоположения в исполняемом файле, в котором он должен прекратить процесс отладки.
Некоторые файлы PDB могут вместо этого находиться в формате файла банка данных протеина. Эти файлы PDB представляют собой текстовые текстовые файлы, в которых хранятся координаты структуры белка.
Другие файлы PDB, вероятно, создаются в формате Palm Database или PalmDOC и используются с мобильной операционной системой PalmOS. Некоторые файлы в этом формате используют расширение .PRC.
Как открыть файл PDB
Различные программы используют собственный PDB-файл для хранения данных в каком-то формате структурированной базы данных, поэтому каждое приложение используется для открытия своего собственного файла PDB. Гениальный, Intuit Quicken, Microsoft Visual Studio и Pegasus - всего лишь несколько примеров программ, которые могут использовать файл PDB в качестве файла базы данных. Radare и PDBparse могут работать и для открытия файлов PDB.
Некоторые файлы PDB хранятся в виде обычного текста, например, файлы Geneyn's Debug Database, и полностью читаются человеком, если они открыты в текстовом редакторе. Вы можете открыть этот вид PDB-файла любой программой, которая может читать текстовые документы, например, встроенную программу «Блокнот» в Windows. Некоторые другие просмотрщики и редакторы PDB-файлов включают Notepad ++ и скобки.
Другие файлы базы данных PDB не являются текстовыми документами и полезны только при открытии с программой, для которой он предназначен. Например, если ваш файл PDB каким-то образом связан с Quicken, попробуйте использовать это программное обеспечение для просмотра или редактирования PDB-файла. Visual Studio ожидает увидеть файл PDB в той же папке, что и DLL или EXE-файл.
Вы можете просматривать и редактировать файлы PDB, которые являются файлами банка данных Protein, в Windows, Linux и macOS с помощью Avogadro. Jmol, RasMol, QuickPDB и USCF Chimera могут также открыть файл PDB. Поскольку эти файлы являются обычным текстом, вы также можете открыть файл PDB в текстовом редакторе.
Palm Desktop должен иметь возможность открывать файлы PDB, которые находятся в формате файла Palm Database, но вам, возможно, придется сначала переименовать его, чтобы расширение файла .PRC для этой программы распознало его. Чтобы открыть файл PDD PalmDOC, попробуйте STDU Viewer.
Как преобразовать файл PDB
Файлы базы данных программы, скорее всего, не будут преобразованы в другой формат файла, по крайней мере, не с помощью обычного инструмента преобразования файлов. Вместо этого, если есть какой-либо инструмент, который может преобразовать этот вид PDB-файла, это будет та же самая программа, которая может его открыть.
Например, если вам нужно преобразовать файл базы данных PDB из Quicken, попробуйте использовать эту программу для этого. Однако этот тип преобразования, вероятно, не только мало используется, но также не поддерживается в этих приложениях базы данных (т. Е. Вам, вероятно, не нужно преобразовывать этот вид файла PDB в любой другой формат).
Файлы банка данных протеина могут быть преобразованы в другие форматы с помощью MeshLab. Для этого вам, возможно, придется сначала преобразовать PDB-файл в WRL с помощью PyMOL из Файл> Сохранить изображение как> VRML , а затем импортируйте файл WRL в MeshLab и используйте Файл> Экспорт Mesh As чтобы в конечном итоге преобразовать файл PDB в STL или другой формат файла.
Если вам не нужна модель для цвета, вы можете экспортировать файл PDB непосредственно в STL с помощью USCF Chimera (ссылка для загрузки выше). В противном случае вы можете использовать тот же метод, что и выше (с MeshLab), чтобы преобразовать PDB в WRL с помощью USCF Chimera, а затем экспортировать файл WRL в STL с помощью MeshLab.
Для преобразования PDB в PDF или EPUB, если у вас есть файл PalmDOC, возможно несколько способов, но проще всего использовать онлайн-конвертер PDB, например Zamzar. Вы можете загрузить свой PDB-файл на этот веб-сайт, чтобы иметь возможность конвертировать его в эти форматы, а также в форматы AZW3, FB2, MOBI, PML, PRC, TXT и других электронных книг.
Чтобы преобразовать файл PDB в формат FASTA, это можно сделать с онлайн-PDB от Meiler Lab до конвертера FASTA.
Также можно конвертировать PDB в формат CIF (Кристаллическая информация) онлайн, используя PDBx / mmCIF.
Расширенное чтение файлов PDB
Вы можете читать намного больше о файлах базы данных программы из Microsoft, GitHub и Wintellect.
Также есть дополнительные сведения о файлах банка данных протеина; см. Всемирный банк данных о белках и PDBB PDB.
Ваш файл все еще не открывается?
Файлы PDB, которые не открываются ни одним из инструментов сверху, вероятно, не являются файлами PDB. Что может случиться, так это то, что вы неправильно читаете расширение файла; некоторые форматы файлов используют суффикс, который очень напоминает «.PDB», когда они действительно не связаны и не работают одинаково.
Например, файл PDF является файлом документа, но большинство вышеперечисленных программ не будут правильно отображать текст и / или изображения, если вы попытаетесь открыть его с помощью этих программ. То же самое относится к другим файлам с аналогичными файлами, такими как PD, PDE, PDC и PDO.
PBD - это еще один, который относится к программе EaseUS Todo Backup и поэтому полезен только при открытии этого программного обеспечения.
Если у вас нет файла PDB, изучите расширение файла, которое имеет ваш файл, чтобы вы могли найти соответствующую программу, которая открывает или преобразует его.
